โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อปรับปรุงและพัฒนาพันธุ์พืช เมล็ดพันธุ์ผักให้เกษตรกรได้มีพืชที่มีสายพันธุ์ที่ดีและมี สะสมสำรองไว้ให้แก่ประชาชนอันเป็นการตอบสนองความต้องการของเกษตรกร และเพื่อเป็นเมล็ดพันธุ์พระราชทานให้แก่ผู้ประสบภัยพิบัติ
การดำเนินงานที่ผ่านมาได้ทำการรวบรวมและพัฒนาพันธุ์พืชพื้นบ้าน เก็บรักษาพันธุ์พืชผักพื้นบ้านให้เกษตรกรมีพันธุ์พืชที่ดีไว้บริโภคในครัวเรือน จำหน่ายและเก็บไว้ทำเมล็ดพันธุ์ อาทิ คะน้า กวางตุ้ง ฟักแฟง แคบ้านดอกขาว ถั่วพู บวบ กระเจี๊ยบเขียว มะเขือยาว มะเขือเปราะขาวกรอบ ถั่วฝักยาว น้ำเต้า และกำลังผลิตพันธุ์ผักเพิ่มอีก ได้แก่ กวางตุ้ง คะน้า ผักบุ้ง มะเขือยาว มะเขือขาวกรอบ ผักสลัด ถั่วแปบ เป็นต้น
นอกจากนี้ยังมีโครงการเมล็ดพันธุ์พระราชทาน เพื่อนช่วยเพื่อน ตั้งขึ้นเพื่อให้ผลิตเมล็ดพันธุ์ผักพื้นบ้านโดยใช้พื้นที่บริเวณบ้านปลูกผักแบบธรรมชาติของชาวบ้าน ปัจจุบันมีผู้เข้าร่วมโครงการจำนวน 889 ครัวเรือน จาก 35 หมู่บ้าน ใน 6 ตำบล ส่วนโครงการบ้านนี้มีรัก ปลูกผักกินเอง เป็นการขยายผลการปลูกพืชผักพื้นบ้านออกสู่ราษฎรโดยนำร่องที่ตำบลโป่งงาม
ปัจจุบันขยายพื้นที่ไปยังตำบลบ้านด้าย ตำสันยาว ตำบลเกาะช้าง และอำเภอแม่จัน และตำบลพุคา อำเภอบ้านหมี่ จังหวัดลพบุรี ซึ่งเมื่อมีเหลือแล้วจึงนำไปจำหน่ายให้ศูนย์พัฒนาพันธุ์พืชจักรพันธ์เพ็ญศิรินำมาวางขายที่ร้านจันกะผักอีกด้วยรวมถึงโครงการ “ซอยนี้มีรัก ปลูกผักแบ่งปัน” มีวัตถุประสงค์ที่จะปลูกไม้ยืนต้นที่บริโภคได้ตามริมถนนในหมู่บ้านเพื่อให้คนทั้งในหมู่บ้านและคนทั่วไปสามารถเก็บใบและผลไปประกอบอาหารรับประทานได้ ศูนย์พัฒนาพันธุ์พืชจักรพันธ์เพ็ญศิริจึงได้จัดหากล้าต้นมะรุม 1,400 กล้า กล้าต้นเสี้ยว 400 กล้า กล้าต้นขี้เหล็ก 400 กล้า และเมล็ดแค 6,500 เมล็ด สนับสนุนโครงการดังกล่าว ปัจจุบันทำให้ชุมชนมีพืชผักที่เป็นอาหารให้ทั้งผู้ที่อยู่ในหมู่บ้านและผู้ที่สัญจรไปมาด้วย
และล่าสุดเมื่อวันพฤหัสบดีที่ 5 มีนาคม 2558 ที่ผ่านมา นายพลากร สุวรรณรัฐ องคมนตรี พร้อมด้วยหม่อมหลวงจิรพันธุ์ ทวีวงศ์ เลขาธิการ กปร. นายสมบูรณ์ วงค์กาด รักษาการที่ปรึกษาด้านการประสานงานโครงการและผู้อำนวยการสำนักประสานงานโครงการพื้นที่ 3 พร้อมเจ้าหน้าที่สำนักงาน กปร. และเจ้าหน้าที่จากหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง เดินทางเข้าเยี่ยมชมการดำเนินงานของโครงการฯ และได้เดินทางไปยังบ้านเกษตรกรที่ร่วมโครงการ จำนวน 3 ราย ได้แก่ บ้านนายฉลอง รินนายรักษ์ ผู้ใหญ่บ้านดงป่าสัก หมู่ 3 ตำบลบ้านด้าย และนางทอง ใจสูง เกษตรกรบ้านสันเกล็ดทอง หมู่ 7 ตำบลโป่งงาม อำเภอแม่สาย จังหวัดเชียงราย เพื่อเป็นขวัญและกำลังใจแก่เจ้าหน้าที่ผู้ปฏิบัติงานและเยี่ยมเยียนราษฎรในพื้นที่.