1. งบประมาณส่วนราชการ
ส่วนราชการในสังกัด 17 หน่วยงาน (รวมองค์การมหาชน) ได้รับจัดสรรงบประมาณปี 2561 รวม 102,559.66 ล้านบาท เพิ่มขึ้นจากปีก่อน 8,141.78 ล้านบาท หรือเพิ่มขึ้นร้อยละ 8.62 โดยมีหน่วยงานได้รับงบค่อนข้างสูง คือ กรมชลประทาน ได้รับสูงสุด57,521.75 ล้านบาท รองลงมาได้แก่กรมส่งเสริมการเกษตร ได้รับ 6,758.80 ล้านบาท และกรมปศุสัตว์ ได้รับ 6,256.72 ล้านบาท
2. งบประมาณรัฐวิสาหกิจ
รัฐวิสาหกิจในสังกัดมี 4 หน่วยงาน คือ การยางแห่งประเทศไทย องค์การตลาดเพื่อเกษตรกร องค์การส่งเสริมกิจการโคนมแห่งประเทศไทย และองค์การสะพานปลา ปี 2561 ได้รับจัดสรรงบประมาณ 3 หน่วยงาน คือ การยางแห่งประเทศไทย องค์การตลาดเพื่อเกษตรกร และองค์การสะพานปลา วงเงินงบประมาณรวม 1,552.56 ล้านบาท ลดลงจากปีก่อน 805.01 ล้านบาท หรือลดลงร้อยละ 34.15
3. งบประมาณกองทุน
ในการดำเนินงานของกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ จะเกี่ยวข้องกับกองทุนที่สำคัญหลายกองทุน อาทิ กองทุนหมุนเวียนเพื่อการกู้ยืมแก่เกษตรกรและผู้ยากจน กองทุนสงเคราะห์เกษตรกร กองทุนจัดรูปที่ดิน กองทุนพัฒนาสหกรณ์ กองทุนการปฏิรูปที่ดินเพื่อเกษตรกรรม กองทุนปรับโครงสร้างการผลิตภาคเกษตรเพื่อเพิ่มขีดความสามารถการแข่งขันของประเทศ กองทุนฟื้นฟูและพัฒนาเกษตรกร ปี 2561 มีกองทุนได้รับจัดสรรงบประมาณเพียง 5 กองทุน วงเงินรวม 2,325.00 ล้านบาท เพิ่มขึ้นจากปี 2560 จำนวน 394.97 ล้านบาท หรือเพิ่มขึ้นร้อยละ 20.46
เมื่อพิจารณาตามกลุ่มงบประมาณที่สำนักงบประมาณกำหนดทั้งหมด 6 กลุ่ม กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ เกี่ยวข้อง 4 กลุ่ม ดังนี้
1) กลุ่มงบประมาณรายจ่ายบุคลากรภาครัฐ 25,823.40 ล้านบาท ลดลงจากปี 2560 จำนวน 61.23 ล้านบาทหรือลดลงร้อยละ 0.24
2) กลุ่มงบประมาณรายจ่ายกระทรวง/หน่วยงาน (Function) 17,765.32 ล้านบาท ลดลงจากปี 2560 จำนวน 7,033.60 ล้านบาทหรือลดลงร้อยละ 28.36 แยกเป็น 2.1) แผนงานพื้นฐาน 14,599.64 ล้านบาท 2.2) แผนงานยุทธศาสตร์ (แผนงานส่งเสริมการดำเนินงานตามแนวทางหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง) 2,809.68 ล้านบาท
3) กลุ่มงบประมาณรายจ่ายบูรณาการ (Agenda) กระทรวงเกษตรและสหกรณ์เกี่ยวข้อง 14 แผน วงเงินรวม 55,580.77 ล้านบาท เพิ่มขึ้นจากปี 2560 จำนวน 13,709.32 ล้านบาท หรือเพิ่มขึ้นร้อยละ 32.74 ประกอบด้วย (1) แผนงานขับเคลื่อนการแก้ไขปัญหาจังหวัดชายแดนภาคใต้ 218.79 ล้านบาท (2) แผนงานจัดการปัญหาแรงงานต่างด้าวและการค้ามนุษย์ 15.84 ล้านบาท (3) แผนงานการส่งเสริมวิสาหกิจขนาดกลางและขนาดย่อม 13.42 ล้านบาท (4) แผนงานพัฒนาพื้นที่เขตเศรษฐกิจพิเศษ 81.85 ล้านบาท (5) แผนงานพัฒนาด้านคมนาคมและระบบโลจิสติกส์ 41.32 ล้านบาท (6) แผนงานพัฒนาเศรษฐกิจดิจิทัล 203.22 ล้านบาท (7) แผนงานการวิจัยและนวัตกรรม 1,001.18 ล้านบาท (8) แผนงานสร้างรายได้จากการท่องเที่ยวและบริการ 7.72 ล้านบาท (9) แผนงานพัฒนาศักยภาพการผลิตภาคเกษตร (เฉพาะหน่วยงานใน กษ.) 9,050.67 ล้านบาท (10) แผนงานพัฒนาเศรษฐกิจฐานรากและชุมชนเข้มแข็ง 2,021.35 ล้านบาท
(11) แผนงานจัดการปัญหาที่ดินทำกิน 68.35 ล้านบาท (12) แผนงานการบริหารจัดการขยะและสิ่งแวดล้อม 74.50 ล้านบาท(13) แผนงานพัฒนาและเพิ่มประสิทธิภาพการใช้พลังงานที่เป็นมิตรกับสิ่งแวดล้อม 10.71 ล้านบาท (14) แผนงานบริหารจัดการทรัพยากรน้ำ 42,771.84 ล้านบาท
4) กลุ่มงบประมาณรายจ่ายพื้นที่ (Area) (แผนงานบูรณาการเสริมสร้างความเข้มแข็งและยั่งยืนให้กับเศรษฐกิจภายในประเทศ(บูรฯ 29)) 7,267.74 ล้านบาท เพิ่มขึ้นจากปี 2560 จำนวน 1,117.25 ล้านบาท หรือเพิ่มขึ้นร้อยละ 18.17กลุ่มงบประมาณรายจ่ายบูรณาการ (Agenda) เป็นกลุ่มงบประมาณที่ได้รับการจัดสรรสูงสุด คิดเป็นสัดส่วนร้อยละ 52.22ของงบประมาณที่ได้รับจัดสรร