นอกจากการจัดฉายภาพยนตร์ของหน่วยงานต่าง ๆ ที่เข้าร่วม แล้ว สสวท. ยังได้ร่วมกับสถาบันการศึกษาต่าง ๆ ในส่วนภูมิภาค 29 แห่ง จัดฉายภาพยนตร์สัญจรให้ครู นักเรียน และประชาชนทั่วไป ในภูมิภาคต่าง ๆ ได้เข้าชมภาพยนตร์วิทยาศาสตร์ไป พร้อม ๆ กับผู้ชมในกรุงเทพมหานคร
การจัดฉายภาพยนตร์สัญจรนั้น จะจัดฉายภาพยนตร์วิทยาศาสตร์ศูนย์ละ 11 เรื่อง ซึ่งเป็นภาพยนตร์ที่ผ่านการคัดเลือกจากคณะกรรมการต่าง ๆ รวมทั้งนักวิทยาศาสตร์ ภาพยนตร์เหล่านี้ได้รับความร่วมมือจากผู้ผลิตภาพยนตร์จากประเทศเยอรมัน ฝรั่งเศส อังกฤษ ออสเตรีย เบลเยี่ยม เดนมาร์ก สหภาพยุโรป รัสเซีย สิงคโปร์ เกาหลี เวียตนาม และไทย ภาพยนตร์ที่จัดฉายนี้ มีทั้งภาพยนตร์ที่เหมาะสำหรับเด็กระดับประถมศึกษา มัธยมศึกษา และระดับมหาวิทยาลัย ตลอดจนประชาชนทั่วไป
ทั้งนี จะมีศูนย์ฉายภาพยนตร์ 4 แห่ง คือ โรงเรียนระยองวิทยาคม จ.ระยอง โรงเรียนปัว จ.น่าน โรงเรียนอุดรพิทยานุกูล จ.อุดรธานี และโรงเรียนห้วยยอด จ.ตรัง ที่นักวิชาการ สสวท. จะเดินทางไปจัดกิจกรรมวิทยาศาสตร์ที่สอดคล้องกับเนื้อหาสาระในภาพยนตร์ ซึ่งนักเรียนจะได้เล่น ทดลอง และตอบคำถามที่สอดคล้องกับเนื้อหาในภาพยนตร์