สำหรับเขตปลอดโรคปากและเท้าเปื่อยภาคตะวันออก ประกอบไปด้วยพื้นที่ 7 จังหวัด ได้แก่ ชลบุรี ระยอง จันทบุรี ตราด สระแก้ว ปราจีนบุรี และฝั่งตะวันออกแม่น้ำบางปะกงของจังหวัดฉะเชิงเทรา ในการควบคุมเคลื่อนย้ายสัตว์และซากสัตว์เข้าเขตจะต้องมีการตรวจสอบจากคณะกรรมตรวจรับรองสัตว์ หรือซากสัตว์เข้าพื้นที่ปลอดโรคปากและเท้าเปื่อยภาคตะวันออก โดยมีปศุสัตว์เขต 2 ผู้ตรวจราชการกรมปศุสัตว์ซึ่งรับผิดชอบพื้นที่เป็นประธาน โดยสัตว์ที่จะเคลื่อนย้ายเข้าพื้นที่จะต้องมาจากฟาร์มปลอดโรคที่ได้รับการรับรอง เลี้ยงอยู่ในพื้นที่ต้นทางมานาน 3 เดือนโดยไม่เป็นโรค ไม่มีการระบาดของโรคในระยะ 10 กิโลเมตร ซึ่งก่อนเคลื่อนย้ายต้องกักดูอาการ 30 วัน เพื่อตรวจสอบว่าไม่พบอาการป่วย และมีการทดสอบทางห้องปฏิบัติการว่าไม่ติดเชื้อโรคปากและเท้าเปื่อย จึงจะได้รับอนุญาตให้เข้าเขตปลอดโรคได้ ขณะที่น้ำเชื้อหรือซากสัตว์ก็ต้องได้รับการรับรองว่ามาจากสัตว์ต้นทางที่ไม่เป็นโรคและไม่มีโรคในพื้นที่ และเนื้อสัตว์ต้องมาจากโรงฆ่าสัตว์ที่ได้รับการรับรองการปฏิบัติที่ดี (Good Manufacturing Practice: GMP) พร้อมทั้งหลักเกณฑ์อื่นๆ ที่กำหนดไว้เพื่อสร้างความเชื่อมั่นว่าจะไม่นำโรคเข้าพื้นที่ นอกจากนี้ จะต้องมีการควบคุมดูแลความสะอาดและทำลายเชื้อโรคให้กับยานพาหนะที่ใช้ขนส่งสัตว์หรือซากสัตว์เข้าพื้นที่ปลอดโรคอีกด้วย