ขณะเดียวกันได้ประสานสำนักงานเขตทั้ง 50 สำนักงานเขต จัดตั้งศูนย์อำนวยการป้องกันและแก้ไขปัญหาน้ำท่วมในพื้นที่กรุงเทพฯ ภายในสำนักงานเขต เพื่อเป็นศูนย์ให้การช่วยเหลือประชาชนที่ประสบเหตุน้ำท่วมหรืออื่น ๆ พร้อมทั้งหน่วยงานต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องสนับสนุนปฏิบัติการฯ เช่น จัดเตรียมเครื่องมือ วัสดุอุปกรณ์ รถยก รถดับเพลิง อุปกรณ์กู้ภัย เครื่องมือและอุปกรณ์บรรเทาสาธารณภัย รถสายตรวจ พร้อมเจ้าหน้าที่ให้การช่วยเหลือรับส่งประชาชนสำหรับจุดที่มีปัญหาน้ำท่วมขังในระดับสูง รวมถึงเจ้าหน้าที่เทศกิจเข้าช่วยเหลือประชาชนพร้อมอำนวยความสะดวกด้านการจราจร
นอกจากนี้ ได้บูรณาการความร่วมมือระหว่าง กทม. กับกรมชลประทาน และหน่วยงาน ที่เกี่ยวข้อง เพื่อการบริหารจัดการน้ำในพื้นที่กรุงเทพฯ ซึ่งที่ผ่านมาได้ทำข้อตกลงและประชุมร่วมกับสำนักงานชลประทานที่ 11 กรมชลประทาน เตรียมความพร้อมบริหารจัดการน้ำ รวมทั้งประสานจังหวัดปริมณฑลและหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง เช่น กรมทางหลวง เพื่อลดผลกระทบที่อาจเกิดขึ้นกับประชาชนได้อย่างทันท่วงทีตลอดช่วงฤดูฝนปี 2568 ทั้งนี้ กทม. ได้เปิดช่องทางการแจ้งเตือนข้อมูลฝนและสถานการณ์น้ำท่วมขังในพื้นที่กรุงเทพฯ แบบเรียลไทม์ผ่านแฟลตฟอร์มต่าง ๆ ของ กทม. ให้ประชาชนได้รับทราบล่วงหน้าอย่างรวดเร็ว เพื่อวางแผน การเดินทางและหลีกเลี่ยงเส้นทางที่มีน้ำท่วมขัง รวมถึงช่องทางแจ้งเหตุเพื่อขอรับความช่วยเหลือ หากประชาชนประสบเหตุสาธารณภัยที่เกิดขึ้นจากน้ำท่วมขังในพื้นที่กรุงเทพฯ ผ่านช่องทางเว็บไซต์ https://dds.bangkok.go.th/, https://pr-bangkok.com/, Facebook:@BKK.BEST, สำนักงานประชาสัมพันธ์ Twitter:@BKK_BEST, สำนักงานประชาสัมพันธ์ โทร. 0 2248 5115 หรือแจ้งผ่านระบบ Traffy Fondue