ส่วนการแก้ไขปัญหาและป้องกันปัญหากลิ่นของมูลฝอยในระยะยาว ได้ปรับปรุงโรงงานกำจัดมูลฝอยทั้งหมดให้เป็นระบบปิด โดยมีระบบบำบัดกลิ่นและฝุ่นละอองต่าง ๆ ปรับปรุงพื้นที่ศูนย์กำจัดมูลฝอยอ่อนนุชเป็นสวนป่าเชิงนิเวศ และเมื่อโครงการสิ้นสุดสัญญาจะพิจารณาเลือกใช้เทคโนโลยีในการกำจัดมูลฝอยสมัยใหม่ที่เหมาะสมกับสภาพแวดล้อมที่มีชุมชนล้อมรอบในปัจจุบัน เพื่อให้สามารถนำมูลฝอยมาใช้ให้เกิดประโยชน์สูงสุด ทั้งนี้ โรงงานกำจัดมูลฝอยจะสิ้นสุดสัญญาในปี 2570 โดยได้ก่อสร้างโรงงานโรงกำจัดมูลฝอยด้วยวิธีการเผาไหม้ เพื่อผลิตพลังงานไฟฟ้าขนาดไม่น้อยกว่า 1,000 ตัน/วัน ซึ่งเป็นเทคโนโลยีที่ทันสมัย มีระบบบำบัดอากาศและมลพิษ และเป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อม
