ทั้งนี้ จากสถานการณ์มหาอุทกภัยน้ำท่วมใหญ่ในปี 2554 ที่มีน้ำท่วมในพื้นที่กรุงเทพฯ แต่ในส่วนของพื้นที่โรงควบคุมคุณภาพน้ำและระบบท่อรวบรวมน้ำเสียที่มีระบบบำบัดน้ำเสียรวมขนาดใหญ่ของ กทม. ทุกแห่ง ไม่ได้รับผลกระทบ หรือพบปัญหาจากสถานการณ์น้ำท่วม เนื่องจากมีระบบมาตรฐานสำหรับระบบป้องกันความปลอดภัยไว้เป็นอย่างดี ตั้งแต่ขั้นตอนออกแบบก่อสร้าง การติดตั้งระบบสูบน้ำและระบายน้ำภายในพื้นที่ระบบบำบัดน้ำเสีย การจัดทำแผนป้องกันโดยปิดล้อมพื้นที่ด้วยกระสอบทราย และซ้อมแผนเผชิญเหตุเป็นประจำทุกปี ขณะเดียวกัน สนน. ตระหนักถึงความสำคัญของระบบบำบัดน้ำเสียหากเกิดสถานการณ์น้ำท่วม ซึ่งอาจจะส่งผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมและการให้บริการกับประชาชน จึงได้เตรียมพร้อมทั้งมาตรการป้องกันและเฝ้าระวังจากโรงควบคุมคุณภาพน้ำทุกแห่งอย่างเคร่งครัด
นางสาววรนุช สวยค้าข้าว รองผู้อำนวยการสำนักสิ่งแวดล้อม (สสล.) กทม. รักษาราชการแทน ผอ.สำนักสิ่งแวดล้อม กล่าวว่า ส่วนของศูนย์กำจัดมูลฝอยของ กทม. สสล. ได้เตรียมความพร้อมและพร้อมเฝ้าระวังผลกระทบด้านสิ่งแวดล้อมจากสถานที่กำจัดมูลฝอยของ กทม. โดยจัดเจ้าหน้าที่เฝ้าระวังสถานการณ์น้ำท่วมภายในศูนย์กำจัดมูลฝอยของ กทม. และเตรียมแผนรองรับสถานการณ์กรณีเกิดอุทกภัย อีกทั้งได้สั่งการให้ผู้รับจ้างเฝ้าระวังและดำเนินตามมาตรการป้องกันผลกระทบที่อาจเกิดจากอุทกภัย จัดเตรียมแผนรองรับสถานการณ์ฉุกเฉิน ตรวจสอบความพร้อมของสถานที่กำจัดขยะมูลฝอย ระบบและอุปกรณ์ที่เกี่ยวข้อง เพื่อให้สามารถดำเนินงานได้อย่างต่อเนื่อง รวมทั้งตรวจสอบและบำรุงรักษาสถานีสูบน้ำภายในศูนย์กำจัดมูลฝอยให้สามารถสูบน้ำไปยังโรงบำบัดน้ำเสียส่วนกลางได้อย่างมีประสิทธิภาพและพร้อมใช้งานตลอดเวลา
นอกจากนี้ สสล. ได้ระดมความร่วมมือจากหน่วยงานที่เกี่ยวข้องทั้งจาก สนน. สำนักงานเขต และกรมเจ้าท่าในการแก้ไขปัญหาผักตบชวาและขยะที่ลอยมากับน้ำเหนือในแม่น้ำเจ้าพระยาจำนวนมาก โดยเฉพาะบริเวณท่าเรือได้จัดเจ้าหน้าที่ตรวจตราและจัดเก็บผักตบชวาและขยะไม่ให้กีดขวางการสัญจรทางน้ำทุกวัน ส่วนการระบายน้ำในช่วงฤดูฝน ได้ร่วมกันเก็บขยะและวัชพืชในคลองอย่างต่อเนื่อง เพื่อเปิดทางให้น้ำไหลผ่านได้สะดวก รวมถึงมอบหมายเจ้าหน้าที่งานกวาด ซึ่งประจำพื้นที่ในถนนสายหลักและถนนสายรองทุกเส้นทาง เฝ้าระวังไม่ให้ขยะปิดบังช่องระบายน้ำลงท่อระบายน้ำและเก็บขยะหน้าตะแกรงในขณะฝนตกทุกครั้ง เพื่อให้การระบายน้ำลงท่อระบายน้ำได้อย่างรวดเร็ว ตลอดจนกำหนดวันเก็บขยะชิ้นใหญ่ในชุมชนริมน้ำเป็นประจำทุกวันอาทิตย์ เพื่อให้ประชาชนมีช่องทางการทิ้งขยะชิ้นใหญ่ ป้องกันการทิ้งขยะลงแหล่งน้ำคูคลอง